OTKA-PD137621

A projekt tartalmának bemutatása:

Csonthéjas gyümölcsűeket fertőző vírusok komoly problémát okoznak a termesztésben és a gyümölcs értékesítésben. A vírusfertőzések ellen nem áll rendelkezésre hagyományos növényvédelmi technológia, ezért nélkülözhetetlen a kiváló minőségű, kórokozómentes szaporítóanyag használata. Vírusfertőzés során a növény védekező rendszere, az antivirális RNS interferencia (RNSi) folyamata aktiválódik, mely során vírus eredetű, a vírus szekvenciájával megegyező kis RNS-ek (21-24nt hosszú RNS-ek) keletkeznek. Csonthéjasokon végzett korábbi vizsgálataink során azt tapasztaltuk, hogy az izolátorházban, magasabb hőmérsékleti körülmények között, aktívabb lehet az RNSi jelensége és változás tapasztalható a kis RNS-ek méreteloszlásában. A kutatás során a gazdasági szempontból jelentős csonthéjas termésű, szilván és ezzel párhumazmosan egy jól jellemzett modell növényen, Nicotiana benthamiana-án vizsgáljuk az izolátorházi körülmények hatását. Vizsgáljuk az RNS interferencia aktivitására, a vírus koncentrációra, mennyiségre gyakorolt hatását újgenerációs szekvenálások alkalmazásával történő metagenomikai módszerekkel. Bioinformatikai módszerekkel azonosítjuk az RNSi kulcs jelentőségű DCL molekuláit szilvában. Így, a kevésbé kutatott, csonthéjasok antivirális RNSi hőmérséklet függő folyamatairól szerezhetünk új információt. Továbbá segíthet megérteni, hogy hatnak ezek a molekuláris folyamatok a vírus kimutatására használt diagnosztikai módszerek érzékenységére.